Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms