Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snap29Q9ERB0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snap29Q9ERB0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms