Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D5Q8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D5Q8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms