Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930449I24RikQ9D5E3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms