Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sugt1Q9CX34 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms