Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PpifQ99KR7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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