Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcd2Q99JR8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms