Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crtc3Q91X84 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Crtc3Q91X84 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crtc3Q91X84 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms