Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpsap2Q8R574 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap2Q8R574 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms