Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx5Q8K1E0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms