Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms