Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh13Q8CEE7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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