Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc28Q80XJ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc28Q80XJ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc28Q80XJ3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc28Q80XJ3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc28Q80XJ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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