Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Shcbp1lQ3TTP0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shcbp1lQ3TTP0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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