Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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