Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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