Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CKAP5Q14008 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CKAP5Q14008 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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