Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col6a1Q04857 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col6a1Q04857 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms