Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gfra1P97785 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra1P97785 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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