Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxd13P70217 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd13P70217 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms