Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csrnp3P59055 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp3P59055 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp3P59055 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csrnp3P59055 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms