Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6fP35460 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms