Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PKHD1P08F94 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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