Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CaluO35887 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CaluO35887 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CaluO35887 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CaluO35887 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms