Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf1B2RRD7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms