Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
TREM1Q9NP99 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TREM1Q9NP99 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
TREM1Q9NP99 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
TREM1Q9NP99 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
TREM1Q9NP99 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
TREM1Q9NP99 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
TREM1Q9NP99 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
TREM1Q9NP99 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
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TREM1Q9NP99 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-4.83□□□□□ -3.18
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TREM1Q9NP99 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
TREM1Q9NP99 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
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TREM1Q9NP99 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
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TREM1Q9NP99 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
TREM1Q9NP99 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
TREM1Q9NP99 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
TREM1Q9NP99 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TREM1Q9NP99 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
TREM1Q9NP99 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
TREM1Q9NP99 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
TREM1Q9NP99 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
TREM1Q9NP99 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
TREM1Q9NP99 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
TREM1Q9NP99 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-5.17□□□□□ -3.24
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