Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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HMCN1Q96RW7 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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HMCN1Q96RW7 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HMCN1Q96RW7 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HMCN1Q96RW7 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HMCN1Q96RW7 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HMCN1Q96RW7 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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