Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PDE6HQ13956 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PDE6HQ13956 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDE6HQ13956 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PDE6HQ13956 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PDE6HQ13956 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PDE6HQ13956 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
PDE6HQ13956 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
PDE6HQ13956 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PDE6HQ13956 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PDE6HQ13956 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
PDE6HQ13956 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
PDE6HQ13956 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
PDE6HQ13956 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
PDE6HQ13956 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PDE6HQ13956 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PDE6HQ13956 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PDE6HQ13956 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
PDE6HQ13956 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
PDE6HQ13956 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
PDE6HQ13956 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PDE6HQ13956 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PDE6HQ13956 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
PDE6HQ13956 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
PDE6HQ13956 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
PDE6HQ13956 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
PDE6HQ13956 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PDE6HQ13956 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PDE6HQ13956 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
PDE6HQ13956 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
PDE6HQ13956 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
PDE6HQ13956 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
PDE6HQ13956 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PDE6HQ13956 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
PDE6HQ13956 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
PDE6HQ13956 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
PDE6HQ13956 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
PDE6HQ13956 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.8 ms