Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
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APOFQ13790 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
APOFQ13790 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
APOFQ13790 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
APOFQ13790 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
APOFQ13790 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
APOFQ13790 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
APOFQ13790 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
APOFQ13790 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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APOFQ13790 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
APOFQ13790 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
APOFQ13790 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
APOFQ13790 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
APOFQ13790 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
APOFQ13790 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
APOFQ13790 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
APOFQ13790 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
APOFQ13790 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
APOFQ13790 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
APOFQ13790 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
APOFQ13790 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
APOFQ13790 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
APOFQ13790 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
APOFQ13790 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
APOFQ13790 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
APOFQ13790 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
APOFQ13790 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
APOFQ13790 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
APOFQ13790 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
APOFQ13790 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
APOFQ13790 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
APOFQ13790 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
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APOFQ13790 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
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APOFQ13790 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
APOFQ13790 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
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APOFQ13790 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
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APOFQ13790 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
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APOFQ13790 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
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APOFQ13790 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
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APOFQ13790 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
APOFQ13790 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
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APOFQ13790 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
APOFQ13790 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
APOFQ13790 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
APOFQ13790 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
APOFQ13790 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
APOFQ13790 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
APOFQ13790 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
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