Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SNX1Q13596 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SNX1Q13596 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SNX1Q13596 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SNX1Q13596 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SNX1Q13596 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SNX1Q13596 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SNX1Q13596 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SNX1Q13596 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SNX1Q13596 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SNX1Q13596 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SNX1Q13596 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SNX1Q13596 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SNX1Q13596 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SNX1Q13596 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SNX1Q13596 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SNX1Q13596 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SNX1Q13596 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SNX1Q13596 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SNX1Q13596 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SNX1Q13596 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SNX1Q13596 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SNX1Q13596 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SNX1Q13596 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SNX1Q13596 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SNX1Q13596 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SNX1Q13596 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SNX1Q13596 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.93□□□□□ -3.04
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SNX1Q13596 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
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SNX1Q13596 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SNX1Q13596 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
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SNX1Q13596 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SNX1Q13596 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
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SNX1Q13596 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SNX1Q13596 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
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SNX1Q13596 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SNX1Q13596 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SNX1Q13596 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SNX1Q13596 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SNX1Q13596 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SNX1Q13596 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SNX1Q13596 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SNX1Q13596 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SNX1Q13596 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
SNX1Q13596 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SNX1Q13596 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
SNX1Q13596 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
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