Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
PTPRDP23468 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
PTPRDP23468 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -2.99
PTPRDP23468 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
PTPRDP23468 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
PTPRDP23468 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
PTPRDP23468 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
PTPRDP23468 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
PTPRDP23468 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRDP23468 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRDP23468 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRDP23468 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPRDP23468 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
PTPRDP23468 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
PTPRDP23468 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
PTPRDP23468 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
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PTPRDP23468 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
PTPRDP23468 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
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PTPRDP23468 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
PTPRDP23468 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
PTPRDP23468 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
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PTPRDP23468 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
PTPRDP23468 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
PTPRDP23468 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
PTPRDP23468 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
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PTPRDP23468 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
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PTPRDP23468 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
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PTPRDP23468 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
PTPRDP23468 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
PTPRDP23468 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
PTPRDP23468 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
PTPRDP23468 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PTPRDP23468 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PTPRDP23468 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PTPRDP23468 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
PTPRDP23468 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
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