Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.94□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SIGMAR1Q99720 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SIGMAR1Q99720 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.06□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SIGMAR1Q99720 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SIGMAR1Q99720 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.24□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SIGMAR1Q99720 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SIGMAR1Q99720 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SIGMAR1Q99720 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SIGMAR1Q99720 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SIGMAR1Q99720 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
SIGMAR1Q99720 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
SIGMAR1Q99720 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
SIGMAR1Q99720 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
SIGMAR1Q99720 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SIGMAR1Q99720 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
SIGMAR1Q99720 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SIGMAR1Q99720 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms