Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SP6Q3SY56 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SP6Q3SY56 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SP6Q3SY56 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SP6Q3SY56 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SP6Q3SY56 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SP6Q3SY56 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SP6Q3SY56 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SP6Q3SY56 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SP6Q3SY56 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SP6Q3SY56 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SP6Q3SY56 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.7 ms