Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CA9Q16790 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CA9Q16790 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CA9Q16790 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CA9Q16790 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CA9Q16790 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CA9Q16790 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CA9Q16790 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CA9Q16790 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CA9Q16790 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CA9Q16790 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CA9Q16790 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CA9Q16790 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CA9Q16790 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CA9Q16790 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CA9Q16790 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CA9Q16790 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CA9Q16790 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CA9Q16790 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CA9Q16790 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CA9Q16790 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CA9Q16790 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CA9Q16790 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CA9Q16790 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
CA9Q16790 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CA9Q16790 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CA9Q16790 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CA9Q16790 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CA9Q16790 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CA9Q16790 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CA9Q16790 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CA9Q16790 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CA9Q16790 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CA9Q16790 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CA9Q16790 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CA9Q16790 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CA9Q16790 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
CA9Q16790 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CA9Q16790 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CA9Q16790 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CA9Q16790 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CA9Q16790 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CA9Q16790 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CA9Q16790 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CA9Q16790 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
CA9Q16790 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CA9Q16790 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CA9Q16790 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CA9Q16790 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CA9Q16790 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CA9Q16790 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CA9Q16790 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CA9Q16790 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CA9Q16790 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CA9Q16790 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CA9Q16790 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CA9Q16790 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CA9Q16790 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CA9Q16790 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CA9Q16790 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CA9Q16790 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CA9Q16790 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CA9Q16790 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CA9Q16790 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CA9Q16790 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CA9Q16790 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms