Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SLC18A3Q16572 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
SLC18A3Q16572 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.86□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SLC18A3Q16572 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
SLC18A3Q16572 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SLC18A3Q16572 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SLC18A3Q16572 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SLC18A3Q16572 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SLC18A3Q16572 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SLC18A3Q16572 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC18A3Q16572 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC18A3Q16572 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SLC18A3Q16572 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SLC18A3Q16572 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SLC18A3Q16572 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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