Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
HERC1Q15751 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
HERC1Q15751 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
HERC1Q15751 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
HERC1Q15751 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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