Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SEC23AQ15436 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SEC23AQ15436 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SEC23AQ15436 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SEC23AQ15436 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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SEC23AQ15436 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SEC23AQ15436 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SEC23AQ15436 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SEC23AQ15436 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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