Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
IFT88Q13099 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
IFT88Q13099 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IFT88Q13099 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.99□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
IFT88Q13099 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IFT88Q13099 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
IFT88Q13099 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
IFT88Q13099 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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