Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAF1Q13077 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TRAF1Q13077 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRAF1Q13077 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAF1Q13077 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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TRAF1Q13077 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAF1Q13077 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRAF1Q13077 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRAF1Q13077 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRAF1Q13077 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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TRAF1Q13077 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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TRAF1Q13077 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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TRAF1Q13077 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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TRAF1Q13077 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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TRAF1Q13077 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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TRAF1Q13077 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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TRAF1Q13077 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRAF1Q13077 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRAF1Q13077 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAF1Q13077 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAF1Q13077 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAF1Q13077 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAF1Q13077 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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