Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
HOXC5Q00444 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
HOXC5Q00444 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
HOXC5Q00444 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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HOXC5Q00444 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
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HOXC5Q00444 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HOXC5Q00444 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HOXC5Q00444 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HOXC5Q00444 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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HOXC5Q00444 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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HOXC5Q00444 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HOXC5Q00444 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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HOXC5Q00444 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HOXC5Q00444 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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HOXC5Q00444 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
HOXC5Q00444 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
HOXC5Q00444 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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