Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PGGT1BP53609 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PGGT1BP53609 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
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PGGT1BP53609 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PGGT1BP53609 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PGGT1BP53609 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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PGGT1BP53609 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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PGGT1BP53609 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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PGGT1BP53609 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PGGT1BP53609 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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PGGT1BP53609 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PGGT1BP53609 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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PGGT1BP53609 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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PGGT1BP53609 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PGGT1BP53609 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PGGT1BP53609 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PGGT1BP53609 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PGGT1BP53609 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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