Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRBP23467 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.82
PTPRBP23467 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PTPRBP23467 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PTPRBP23467 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PTPRBP23467 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRBP23467 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms