Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SGCEO43556 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
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SGCEO43556 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SGCEO43556 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SGCEO43556 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SGCEO43556 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SGCEO43556 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
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SGCEO43556 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SGCEO43556 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SGCEO43556 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.99□□□□□ -2.89
SGCEO43556 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SGCEO43556 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SGCEO43556 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SGCEO43556 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SGCEO43556 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SGCEO43556 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SGCEO43556 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SGCEO43556 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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SGCEO43556 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SGCEO43556 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
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SGCEO43556 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SGCEO43556 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SGCEO43556 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SGCEO43556 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
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SGCEO43556 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SGCEO43556 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
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SGCEO43556 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
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SGCEO43556 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
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SGCEO43556 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SGCEO43556 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SGCEO43556 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SGCEO43556 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SGCEO43556 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SGCEO43556 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
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SGCEO43556 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SGCEO43556 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
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