Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-6.33□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-6.35□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-6.36□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-6.37□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
NRXN3Q9Y4C0 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-6.41□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-6.42□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-6.42□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-6.43□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-6.43□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-6.43□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-6.46□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-6.46□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-6.46□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.44
NRXN3Q9Y4C0 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-6.48□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-6.48□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-6.5□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-6.51□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-6.52□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-6.54□□□□□ -3.46
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-6.54□□□□□ -3.46
NRXN3Q9Y4C0 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-6.55□□□□□ -3.46
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-6.56□□□□□ -3.46
NRXN3Q9Y4C0 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
NRXN3Q9Y4C0 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-6.6□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-6.6□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-6.61□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-6.63□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
NRXN3Q9Y4C0 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-6.67□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-6.67□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-6.69□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-6.71□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-6.75□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-6.76□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-6.78□□□□□ -3.49
NRXN3Q9Y4C0 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-6.79□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-6.8□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-6.82□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-6.83□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-6.83□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-6.84□□□□□ -3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms