Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN8AQ9UQD0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
SCN8AQ9UQD0 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN8AQ9UQD0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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SCN8AQ9UQD0 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN8AQ9UQD0 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN8AQ9UQD0 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN8AQ9UQD0 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
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