Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PRRT1Q99946 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PRRT1Q99946 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PRRT1Q99946 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.2 ms