Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
LONRF1Q17RB8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
LONRF1Q17RB8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
LONRF1Q17RB8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.7□□□□□ -2.68
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LONRF1Q17RB8 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
LONRF1Q17RB8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
LONRF1Q17RB8 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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