Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRIP11Q15643 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRIP11Q15643 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRIP11Q15643 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRIP11Q15643 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.72□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRIP11Q15643 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms