Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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SS18Q15532 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SS18Q15532 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SS18Q15532 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SS18Q15532 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SS18Q15532 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SS18Q15532 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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SS18Q15532 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SS18Q15532 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SS18Q15532 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SS18Q15532 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SS18Q15532 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SS18Q15532 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SS18Q15532 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SS18Q15532 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SS18Q15532 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
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SS18Q15532 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SS18Q15532 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SS18Q15532 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SS18Q15532 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
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