Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
KARSQ15046 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
KARSQ15046 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
KARSQ15046 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
KARSQ15046 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
KARSQ15046 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
KARSQ15046 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
KARSQ15046 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
KARSQ15046 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
KARSQ15046 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
KARSQ15046 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
KARSQ15046 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
KARSQ15046 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
KARSQ15046 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
KARSQ15046 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
KARSQ15046 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
KARSQ15046 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
KARSQ15046 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
KARSQ15046 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
KARSQ15046 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
KARSQ15046 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
KARSQ15046 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
KARSQ15046 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
KARSQ15046 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
KARSQ15046 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
KARSQ15046 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
KARSQ15046 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
KARSQ15046 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
KARSQ15046 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
KARSQ15046 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
KARSQ15046 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
KARSQ15046 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
KARSQ15046 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
KARSQ15046 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
KARSQ15046 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
KARSQ15046 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
KARSQ15046 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
KARSQ15046 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
KARSQ15046 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
KARSQ15046 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
KARSQ15046 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
KARSQ15046 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
KARSQ15046 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
KARSQ15046 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
KARSQ15046 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
KARSQ15046 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
KARSQ15046 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
KARSQ15046 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
KARSQ15046 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
KARSQ15046 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
KARSQ15046 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
KARSQ15046 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
KARSQ15046 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
KARSQ15046 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
KARSQ15046 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
KARSQ15046 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
KARSQ15046 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
KARSQ15046 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
KARSQ15046 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
KARSQ15046 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
KARSQ15046 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
KARSQ15046 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
KARSQ15046 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
KARSQ15046 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
KARSQ15046 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
KARSQ15046 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
KARSQ15046 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms